Слышать невидимое: как в MIT переводят структуру паутины и белков в музыку

World Science Festival 14,9 тыс. 1 ч 11 мин 4 мин 02.02.2021
Главное

Музыка материи: как MIT превращает паутину и протеины в искусство и новые материалы

Лид: Профессор MIT Маркус Бюлер представляет революционный взгляд на материаловедение, где грань между физикой, биологией и музыкой стирается. Используя звуковые вибрации как универсальный язык, ученые учатся «слышать» структуру белков, играть на паутине как на арфе и проектировать материалы будущего с помощью искусственного интеллекта и музыкальных партитур.

🕷️ Паучья ферма в MIT: архитектура без чертежей 3:15

В отличие от человеческого инжиниринга, где для строительства зданий требуются подъемные краны, строительные леса и детализированные планы , природа использует иной подход. В лабораториях Массачусетского технологического института (MIT) создана специальная «паучья ферма» для изучения процесса самоорганизации биологических структур .

Процесс создания паутины — это замкнутый цикл переработки материи:

Маркус Бюлер отмечает поразительное гендерное неравенство в мире пауков: большинство строителей — самки, в то время как самцы некоторых видов составляют лишь 1% от их размера и часто погибают вскоре после спаривания .

🕸️ Сканирование вселенной внутри паутины 11:12

Традиционно паутину представляют как двумерную радиальную сеть, однако большинство видов строят сложные трехмерные структуры, напоминающие густые облака или целые города . Чтобы изучить их, команда Бюлера совместно с художником Томасом Сарасено разработала технологию лазерного сканирования :

  1. Паука помещают в специальный каркас, защищенный водой, чтобы исключить побег .
  2. Листовой лазер слой за слоем подсвечивает сечения сети, а камеры делают сотни тысяч снимков .
  3. Алгоритмы реконструируют цифровую 3D-модель, состоящую из узлов и связей, которая позволяет заглянуть внутрь структуры, не разрушая её .

По словам Бюлера, внутри паутина выглядит как «маленькая вселенная» с участками разной плотности: от жилых зон и мест хранения добычи до коридоров для передвижения .

🎹 Слышать материю: паутина как музыкальный инструмент 19:22

Любой звук можно представить как набор синусоидальных волн разной частоты и громкости . Бюлер проводит прямую аналогию: синусоиды — это элементарные строительные блоки звука, подобно тому как аминокислоты — блоки белков .

Поскольку паутина состоит из тысяч натянутых нитей, она фактически является гигантским струнным инструментом. Учёные перевели физические параметры нитей (длину, натяжение, плотность) в звуки, создав виртуальную реальность :

Команда проводит живые перформансы, где исследователи (например, докторант Изабель) «играют» на цифровых моделях паутины внутри кубических проекций .

🧬 Сонификация белков: когда мутация звучит фальшиво 43:10

Молекулы в учебниках химии рисуют статичными, но в реальности они постоянно вибрируют из-за кинетической энергии . Команда Бюлера рассчитала вибрационный спектр для всех известных белков из мирового банка данных (Protein Data Bank) .

Ключевые открытия в области «звука белков»:

🤖 Проектирование материалов через ноты и ИИ 54:35

Главный вопрос курса: можно ли использовать фортепиано для создания нового белка? Бюлер отвечает утвердительно. Его команда разработала мобильное приложение с 20 клавишами — по одной на каждую основную аминокислоту .

Процесс проектирования выглядит так:

  1. Ученый или композитор «играет» мелодию на аминокислотной клавиатуре .
  2. Приложение переводит последовательность звуков в химическую последовательность.
  3. Искусственный интеллект, обученный на сотнях часов «белковой музыки», предсказывает структуру и свойства получившегося вещества .

Использование нейросетей позволяет избежать ограничений человеческого музыкального вкуса. ИИ может генерировать белковые последовательности, которые никогда не встречались в природе в ходе эволюции . Одним из практических результатов стали новые виды белков для покрытия продуктов питания (например, клубники), которые значительно увеличивают их срок хранения .

💥 Звук катастрофы: сингулярность трещины 1:09:38

В завершение Бюлер демонстрирует, как звучит процесс разрушения материала. Используя математические решения для полей напряжения вокруг трещины, исследователи создали звуковую модель «сингулярности» .

Когда наблюдатель в звуковом пространстве приближается к кончику движущейся трещины, изначальная чистая синусоида начинает искажаться, сжиматься и растягиваться под воздействием колоссальных сил напряжения . Это позволяет человеку на интуитивном уровне, через слух, ощутить физику предельных состояний материи.

💬 Цитаты

«Молекулы на самом деле не статичны... при любой конечной температуре каждый атом в системе находится в постоянном движении.»

Маркус Бюлер 43:47

«Мы можем использовать звук как способ проектирования совершенно новых белков, новых материалов в целом.»

Маркус Бюлер 33:40

«Паутина звучит так необычно, потому что её нити не следуют правилам западной музыкальной теории.»

👥 Спикер
🔗 Упомянутые сайты и проекты
📖 Термины
Сонификация
Преобразование данных или физических параметров в звуковые сигналы.
Транспозиционная эквивалентность
Принцип в музыке, согласно которому мелодия узнаваема независимо от высоты регистра, в котором она исполняется.
Сингулярность трещины
Математическая точка в материаловедении, где механические напряжения стремятся к бесконечности у самого края разлома.
📊 Цифры
🗓 Хронология
  1. 1867 Ученые того времени представляли структуру бензола в виде определенных геометрических моделей.
  2. 2021 Проведение выставок и перформансов в Париже (Palais de Tokyo) с использованием инструмента-паутины.
⚖️ Другая сторона
Наука Markus Buehler MIT паутина сонификация белков нейронные сети